作為高中特色建設的重要推手，地方教育行政部門首先要認清區域推動學校特色建設的價值取向與重要意義，才能保證實際工作不會出現偏差。
（一）優化區域教育布局，多在類型上下功夫，少在層次上做文章
地方教育行政部門推進學校特色建設，就是要根據區域高中教育發展的現實情況與未來需要，進行教育資源的合理布局，激發學校自主發展的活力，為各級各類不同層次的高中提供發展的空間與機遇，引導學校合理定位發展方向，優化發展所需的各種資源，使每所學校尤其是普通學校在原有基礎上獲得較快發展，整體提升區域教育質量。
區域推進學校特色建設，要多在類型上下功夫，少在層次上做文章。地方教育行政部門要轉變高中發展的原有思路，通過高中特色化發展，讓每個學校都可以根據自己的曆史基礎，結合當下的現實需要，借助錯位競爭、差異發展，辦出自身特色，實現高中的多元發展。如南京市提出將在未來10年重點建設“綜合改革高中”“學科創新高中”“普職融通高中”以及“國際高中”等4種模式的普通高中，推動南京市的高中特色發展[1]。
（二）優化高中教育秩序，擴大優質資源，實現教育公平
近年來，普通高中“擇校熱”問題已經成為聚訟之地。在很多地方，少數的一枝獨秀示範高中與大量的一般高中並存，校際之間的教育教學質量差距明顯，學生及家長一般通過分數、權力或金錢來獲得進入優質高中的選擇權。在我國，普通高中擇校，說到底是因為教育資源嚴重不均衡引起的，它的存在有損於教育公平，加劇了因為普通高中教育帶來的社會分層，容易產生教育領域的腐敗或權力尋租。因此，《教育規劃綱要》提出把促進公平作為國家基本教育政策，教育公平是社會公平的重要基礎。而教育公平的主要責任在政府，政府應該促進高中辦學體製多樣化，擴大優質資源。