在宏觀層麵上，職業教育的管理體製缺乏與教育外部關係的統籌協調，在政府幹預係統中突出表現為缺少能夠協調各部門的統籌機構和統一領導。在中觀層麵上，在教育係統內職業教育的管理也是多頭的，同樣缺乏教育內部的溝通與平衡發展，職業教育被邊緣化的現象在很多地方的教育部門中客觀存在。在微觀層麵上，各級職教行政部門尚未完全擺脫政府主導幹預的模式，難以代替學校或其他業務服務部門管理具體工作，客觀上不可避免地束縛了學校自主辦學的行為。具體表現在以下幾個方麵。
（一）“多頭”管理
當前，我國職業教育院校中除了有100多所是由中央部門和相關單位創辦的外，很多都是由地方創辦的。除教育部門外，很多其他部門也在舉辦各類職業教育。職業教育的舉辦主體過多，導致職業教育的管理主體過多，而且管理標準不統一。具體體現為：宏觀層麵，職業學校的專業及地域設置重複的問題突出，導致職業教育與普通教育的比例失衡，職業教育發展難以滿足區域經濟社會發展對技術技能型人才的需求；微觀層麵，“多頭”管理使得資金支持不夠、師資力量分散、教學設施設備不全、規模小，導致職業教育質量低下、吸引力不足等問題。因此，以政府為主體的科層管理體製難以適應職業教育開放辦學的發展趨勢，建立多元合作的職業教育管理體製成為當務之急。
（二）“無力”管理
我國職業教育管理存在“無力”管理的現象，尤其是行業性特征比較強的職業學校，必須依靠行業部門管理，教育主管部門“無力”管理。例如人社部門舉辦的各類技工學校、衛生部門舉辦的各類衛生院校等，這些部門舉辦的職業院校數量龐大，管理機構龐雜，職能不清。盡管管理部門有了較為明確的分工，以教育部門為主，人社、財政等部門積極配合，可因為這些部門之間是平行關係，所以要綜合協調各自的工作非常有難度，無法在製度、政策製定上達成一致。各部門各自為政，使得運行很不通暢。教育行政部門內部也存在高教與職教係統缺乏協調的問題，未能以完整、統一的眼光看待職業教育，因而管理運行難度很大。職業教育係統要健康運行，就需要相關部門各司其職，共同協調運轉。[12]