我國高等教育評估從無到有，再到具有一定的規模和當前的發展水平，獲得了全社會不同群體的普遍關注。當前高等教育評估活動的民間參與性及其程度，以及將評估與質量的持續改進和質量保障相結合的發展趨勢等，都在一定程度上反映出國際高等教育評估發展的時代特征。更重要的是，這一切隻是在很短的時間內完成的，所以，無論從何種角度來說，我國高等教育評估所取得的成績都是巨大的。但這是僅就我們的基礎而言的進步，就我們的目標和高等教育評估的實際效果而言，要取得進一步的發展，我們還有很多問題需要解決。
目前，我國的高等教育評估工作的主要問題有以下四個。