為改變現今教育部直屬高校分布極不均衡的格局，合理布局教育部直屬高校，建議在目前沒有教育部直屬高校的13個省、區（或加新疆生產建設兵團，下同）各設1所教育部直屬高校。
目前75所教育部直屬高校分布為：北京24所；上海8所；江蘇、湖北各7所；陝西5所；四川4所；山東3所；廣東、天津、重慶、湖南、遼寧、吉林各2所；浙江、黑龍江、安徽、甘肅、福建各1所；其餘的河南、河北、江西、山西、青海、貴州、海南、雲南、內蒙古、寧夏、新疆、西藏、廣西13省區均為0所。教育部直屬高校在全國各省（市、區）分布不均衡有其曆史、經濟、地理、體製等原因，而長期以來高考錄取采用分省定額的方式，導致許多部屬高校在屬地與外地的招生比例相當懸殊，不但引起了許多省、區民眾的不滿，也誘發了“高考移民”等不良現象。盡管在教育部的引導和規範下，教育部直屬高校近年來已經逐漸減少了屬地招生的比例，但因為各省（市、區）教育部直屬高校分布很不均衡，教育部直屬高校在各省（市、區）招生的總數與當地人口總數的比例，各省（市、區）之間仍很懸殊。
從曆史角度考察，民國時期的國立大學最多共設過32所，其中上海4所，北京3所，江蘇、天津、浙江各2所，吉林、遼寧、湖北、山西、陝西、四川、廣西、廣東、湖南、江西、重慶、安徽、山東、河南、貴州、甘肅、福建、雲南、台灣各1所。民國時期國立大學雖在總量上不多，但在各省、區的具體分布上基本呈現為“扁平化結構分布格局”，即大部分省、區至少有一所國立大學，且未出現明顯的兩極分化現象。一直持續辦學至今的非教育部直屬大學如西北大學、河南大學、山西大學、安徽大學、雲南大學、廣西大學、貴州大學等在民國時期均是國立大學。