合作型學校從本質上講就是一個大的學習共同體，其組織結構是一個複雜的大係統，它是合作學習向縱深發展的結果，總的來講，具有如下兩個基本特征。
第一，在組織形態上，非常強調普遍運用團隊工作模式與運用合作程序。所謂合作型學校就是一所以團隊為基礎的高績效學校。在合作型學校中，團隊支配著學生的課堂生活和教職工的學校生活。合作型學校在課堂中綜合運用的學習團隊就包括正式合作學習小組、非正式合作學習小組、合作基層小組、合作腳本以及學術爭論五種類型；而合作型學校中的教職工團隊也至少包括同事教學小組、任務組以及臨時決策小組三種類型。在合作型學校中，團隊是學習、教學和管理的基本單元。[6]合作型學校中團隊的目的在於持續改善學習、教學和管理的質量，從根本上改變了學生、教師和行政管理人員的工作方法，打破個體相互隔離的障礙，發展學生與學生之間、同事與同事之間的支持性的個人關係。合作型學校中各種團隊的形成、培育和發展將成為影響合作型學校提高教育質量的核心因素。總的來說，團隊是合作型學校的組織基礎和組織保障，合作精神則是團隊組織的靈魂。
第二，在教學範式上，追求新教學理念，希冀實現新教育理念指導下高效能教學。舊的教學範式強**學就是教師向學生傳遞知識的過程，教師的工作就是給予知識，學生的工作則是接受知識，學生被視為待用知識填滿的空的容器，學生被看作被動的知識接受者，學生被依據各種標準劃作不同的等級和類別。在此理念的影響下，許多教師在教學過程中要求學生被動、安靜、孤立，強調學生間的競爭，而不是彼此間的合作與共同提高。經過幾十年的理論和研究進展，新的教學範式日漸形成。合作型學校就追求教學範式由舊向新的轉變，強**學過程是教師和學生共同構建的，學生是構建、發現、轉變和擴展知識的主體，學生會主動地構建他們自己的知識，一個教師的責任不是傳授現成的知識，而是激發學生的努力，培育學生的才能與能力。教師與學生之間是一種個人的相互交換的關係，合作學習是新教學範式實施的一種有效手段。不難發現，新教學範式中的“培育和發展”的哲學觀漸漸取代舊教學範式中的“選擇和淘汰”的哲學觀。人們認識到教育的根本目的在於促進學生的發展，學校工作的根本任務在於育人。育人是受教學觀念影響的。因此，合作型學校就是要用新的教學理念來指導學校的育人工作，追求學校教育的高效能，追求學生學習、教師教學和行政管理的持續完善。