在北京市自閉症兒童康複協會的影響下，最近幾年在各地陸續出現了越來越多的政府和民間自發組織—康複協會、家長聯誼會、自閉症訓練機構等，民營的自閉症兒童訓練機構已由20世紀90年代初的一家發展到現在的幾百家。從20世紀90年代末開始，全國一些大城市中的培智學校、普通學校、幼兒園也開始招收自閉症兒童隨班就讀。
目前，我國的自閉症康複教育機構，已初步形成了具有中國特色的不同服務模式[31]：
（1）由殘聯主管的全公辦學校模式（如廣州康納學校），優點是資金充足、硬件條件優越、師資力量雄厚、發展後勁充足。
（2）由教育部門主管的全公辦教育模式（如北京海澱培智學校），優點是幼小結合及與智障學生的融合教育。
（3）以各省殘疾人康複中心自閉症科為代表的由殘聯主管的公辦模式（如殘聯內部的幹預部門），優點是充分利用殘疾人康複設施及資源，將自閉症康複辦成了特色康複內容。
（4）民辦公助模式（如常州天愛學校），這種模式的優勢是政府購買服務到位，解除了民辦學校在資金、場地和師資方麵的後顧之憂（政府會對下屬機構進行相關的師資培訓，對機構內部的培訓比較係統、密集），又保留了民辦機構的運營靈活、服務專業、敬業度高的優點，民辦公助這種模式成為最值得思考和借鑒的模式之一。
（5）民辦機構（如北京星星雨、五彩鹿，青島以琳、深圳自閉症研究會），經過長期發展，已經具備相當規模，優勢是專業成熟、理念先進、經驗豐富、具有極強的進取精神；同時政府也有意對這些具有代表性的較為正規的民辦機構提供購買服務支持，以及進行定點機構規範化檢查等管理。
（6）大齡自閉症人士養護模式（如慧靈），初步具備了“組合之家”的雛形，代表著未來自閉症成年養護的發展趨勢，有著相當可取的經驗和成功之處；對未來自閉症服務機構的發展和管理模式有積極的借鑒意義。