弗洛伊德在其《自傳》中說：“從某種意義而言，我對於原先起跑的那一線工作已失去了興趣，布呂克為我指定的題目是最低等的魚類的脊椎研究。如今，我開始轉而去研究人類的中樞神經係統……而我之所以選延腦作為我的唯一研究對象，其實也表明了我的發展的連貫性。和我初入大學時無所不學的情形相反，我如今卻產生專注於一項工作、一個專題的傾向，而且這個傾向一直繼續下去……
這時，我又恢複到以前在生理實驗室時那樣，起勁地在腦解剖研究裏工作。在這些年裏，我發表了好些有關延腦內神經核及神經通路的研究論文……
從實用的觀點看來，腦解剖研究絕不比生理學好，再加上我考慮到材料來源問題，所以，我就轉而開始研究神經係統的疾病。在那時候的維也納，還很少有這一醫學分支的專家，所以可資研究的材料都散見於醫院的各個科，而且也沒有學習研究這方麵學問的適當機會，隻好靠無師自通的方法去學習。即使是不久前，因關於大腦功能定位著述而得到提升的諾斯納格，也未能將神經病理學（neuropathology）和醫學的其他分支區別開來……以後的幾年裏，在繼續擔任住院醫師期間，我發表了多篇神經係統器質性疾病的臨床觀察報告，漸漸地對這方麵的疾病已能駕輕就熟，甚至已能很準確地指出在延腦中的病灶位置，使得病理解剖先生們對我的臨床分析毫無補充的餘地。同時，我又是在維也納第一個把診斷為急性多發性神經炎的病人送請病理解剖的人。”
由於弗洛伊德在神經組織學和臨床治療方麵的成績顯著，1885年9月，他被任命為維也納大學醫學院神經病理學講師。須知，當時維也納綜合醫院沒有幾位教授，全是由40名助理醫師撐起來的，其中一等助理醫師10名，像弗洛伊德這樣的二等助理醫師有30名。二等助理醫師從申請講師到批準需一年之久。根據德國和奧地利的規定，弗洛伊德所擔任的隻是無報酬的講師職務，這種職務的講師無權參加係裏召集的會議，也不付給工資。他隻能為一些醫學係班級主持供學生選修的專題。任這一職務的教師雖然沒有報酬，但往往很受尊敬。一般來說，隻有在某些方麵有所專長的學者才有資格擔任這種職務；而且隻有任這一職務不久才有晉升教授的希望。不僅如此，還因為隻有當上了講師，才能開辦第一流的私人診所，並能享有在大學開設講座的特權。1885年1月21日弗洛伊德遞交的講師申請書寫道：“如果學院尊敬的教授們能授予我神經病專業的講師職稱，我將從兩個方麵促進人體病理學的這一分支的教學……”布呂克教授主動要求由他來審查弗洛伊德的工作並起草提名報告。他寫道：“弗洛伊德博士撰寫的顯微解剖學論文中的結論已經得到了廣泛的承認……他受過良好的全麵教育，性格文靜而嚴肅，在神經解剖領域是一位出色的工作者，頭腦敏捷，思路清晰，對本專業各種文獻有廣博的知識，掌握了嚴謹的演繹法，具有很高的文字表達的組織才能……”接著，諾斯納格教授和梅納特教授在布呂克教授的推薦書上熱情地簽了名。他們三位教授組成資格審查委員會，可能因為他是猶太人的關係，故弗洛伊德以19比3選票獲得了講師的職稱。