餘書藏中所收《壇經》不下十餘種，其最佳者為明正統四年黑口刻本。每半葉八行，行十六字，字大悅目，元槧本典型尚存，氣象靜穆可敬。其次則為嘉靖間五台山房刻本。每半葉九行，行十八字，古意猶存，尚為佳帙。茲以兩刻本，校勘其異同。正統本之優點，為法海所撰《壇經略序》，尚未改為《六祖大師緣起外紀》，其序文亦未為後人所竄亂。正統本有無名氏《跋》一首，嘉靖本則摘錄《跋》中之語，名曰《曆朝崇奉事跡》，而刪其《跋》。正統本共分九品，曰《悟法傳衣第一》；嘉靖本改為《行由第一》，分其後半為《般若第二》。正統本曰《釋功德淨土第二》，嘉靖本改為《疑問第三》。正統本曰《定慧一體第三》，嘉靖本改為《定慧第四》。正統本曰《教授坐禪第四》，嘉靖本改為《坐禪第五》。正統本曰《傳香懺悔第五》，嘉靖本改為《懺悔第六》。正統本曰《參請機緣第六》，嘉靖本改為《機緣第七》。正統本曰《南頓北漸第七》，嘉靖本改為《頓漸第八》。正統本曰《唐朝征詔第八》，嘉靖本改為《宣詔第九》，近刻本又改為《護法》。正統本曰《法門對示第九》，嘉靖本改為《付囑第十》。其間字句之不同者尤不勝枚舉。於以知《壇經》之竄亂，其在正德、嘉靖間乎？明人好竄改古書，已成為風俗，不獨於佛經為然也。餘尚有嘉靖小字刻本，及閔刻朱墨本，亦為《壇經》中之佳品。此外則有福建鼓山刻本、長沙刻本、金陵刻本、如皋刻本等，皆近時普通單行本也。
《壇經》最要之宗旨，在於示明一切萬法，皆從自性生。自性即是自心，自心即是真佛，故不必舍自佛而求他佛，但覓自心佛可也。其重要之下手處，在於依法修行。修須自修，行須實行。其所修、所行者，先去殺生、偷盜、邪**、妄語、兩舌、惡口、綺語、貪欲、瞋恚、癡愚等十惡，再去邪見、邪思、邪語、邪業、邪命、邪方便、邪念、邪定等八邪。去十惡八邪，即是除自性中不善心、嫉妒心、諂曲心、吾我心、誑妄心、輕人心、慢他心、貢高心，及一切時中不善之行。常自見己過，不見他人之是非善惡，是之謂歸依自性天真佛。故六祖謂慈悲即是觀音，喜舍名為勢至，能淨即釋迦，平直即彌陀也。若不能依法實行，口善心不善，雖誦經念佛奚益？南轅而北其轍，其去真佛也遠矣。