企業的自主創新是通過有效的技術創新機構來具體完成的。一般把能使知識變成技術的現代化實驗室，稱為技術創新的孵化器，也就是企業進行自主創新的主要機構。這裏的實驗室是一個統稱，它包括了各種技術創新中心、技術研發中心等。知識轉化成技術，需要有現代化的一流的實驗室作保證。沒有一流的實驗室和實驗設備，再出色的技術人才也不可能創造出新技術。因此，企業在自主創新過程中，必須重視創新機構的建設，為技術人才提供良好的創新環境。
不過，現在好多地方政府對此理解錯了，把技術開發區理解成技術創新的孵化器，認為隻要建成開發區，技術人才就有了創新的環境，就可以產生新技術了，於是，在建立技術開發區後，給海外留學生寫信說，你們回來吧，我們這裏有孵化器，但是留學生回來一看，發現隻有一些地和房子，沒有現代化的實驗室，結果又走了。因此，高科技開發區不能簡單的等同於技術創新的孵化器，實驗室才是企業自主創新的機構。
實驗室的建設，實際就是技術創新中心的建設，需要形成實驗室經濟。實驗室經濟是以實驗室研發為中心，形成實驗室產業，吸引社會各個方麵的投資，為自主創新提供資金、人才、市場等。實驗室作為產業投資方向，必然會帶來分配製度的企業化，優秀科研人員的報酬會很高，從而激勵他們獻身於實驗室，研發出大量的原創技術。目前，我國沒有完整的實驗室經濟，技術人員比較浮躁，過分追求短期收益，弄虛作假之風盛行，自主創新缺少良好的機構保證。
實驗室作為一種經濟形態，應該具有以下特征。第一，投資主體多元化。實驗室可以吸引社會投資，是一種多元化的投資載體，投資者不需要了解實驗室的機密，也不需要幹預實驗室的運行，隻需要追求投資回報。第二，運行企業化。實驗室的運行是一種企業的經營過程，以追求經濟效益為核心，是自主經營和自負盈虧的經濟實體，不是一種沒有經濟活力的行政機構。第三，分配效率化。實驗室的分配原則強調效率，而不強調公平，優秀的科技人員是高收入者，各種要素充分流動，從而保證分配效率的持續可行。第四，產出技術化。實驗室生產的並不是某種產品，而是技術，將技術創新作為自己的主要產出目標。第五，主體市場化。實驗室是一個市場主體，將滿足市場需求作為自己的發展方向，即使是國家保密的實驗室，也可放開自己的市場，因為市場所需要的是某種技術，而不是要了解實驗室的秘密。第六，發展社會化。實驗室不是一種自我封閉的體係，而是與社會各界有著充分的聯係，包括資金聯係和市場聯係，為社會上的各種客戶和各種投資者服務。