就近代中國曆史而言，還不曾有任何一種學說像進化論那樣富有魅力：它深深地震撼了中國人的心靈，從而給中國近代曆史的進程打上了自己的烙印。進化論為國人提供了一種嶄新的宇宙觀，他們借此觀察身在其中的自然界和人類社會，開始發現所謂“天不變道亦不變”、“如環無端”靜止僵化的傳統世界消失了；呈現在眼前的是一個遠為生動的大千世界：萬物生生不已，盡在天演之中。緣此，一切都有了新的意義，一切也都需要重新評判。它引導人們走出蒙昧，最終跨入了理性的時代。
國粹派所以超越傳統士人，構成了新型知識分子群的一翼，歸根結蒂，也是因為他們確立了這一新的宇宙觀。
關於國粹派的進化論思想，這裏集中論述其變異的自然觀。其社會曆史進化的觀點，留待下一節論述。
國粹派對宇宙自然界進化最具特色的見解，主要集中在以下方麵：
（一）關於天體、地球的進化觀念
近代西方天文學所提供的宇宙天體新知，使國粹派對於“天”的傳統觀念，渙然冰釋。章太炎說，古人以“天為積氣”，以為日星地球，皆受於天，是不對的。果是如此，當是“愈近天則氣愈厚，愈遠天則氣愈薄，今何以地球以上，愈高而氣愈薄耶？”[1]他認為，人望天際蒼蒼，那是因為各行星周圍蒙有阿屯、以太所成的空氣。人眼透過空氣外望，自成蒼蒼迷蒙之態。所以宇宙間除了無量星球之外，實空無一物。對此，馬敘倫持相同的見解，他說：“餘亦以謂天不盡積氣，使果氣體，試自地而上，曆十餘萬尺，氣已浸薄，彼之星球又孰維而孰主之乎？”[2]但“不盡積氣”一詞，稍嫌遊移。高亞賓的說法就明確多了。他以為，離地球二萬餘尺的上空，已沒有“養素”，因此，在地球空氣界與其他星球的空氣界之間，“未能遽接，則真無氣矣”，便出現了真空地帶。無氣的真空地帶，自然不得稱之為“天”[3]。國粹派個人的表述雖有差異，但他們斷然否定人格化的“天”即上帝的存在和災異說，卻是共同的。例如，章太炎說，“天且無物，何論上帝？”[4]馬敘倫也指出，西方天文學日明，“誰複能襲五行之相應，持占候之術哉！”[5]