自從輪船參與運漕以來，木帆船過剩的問題就開始凸顯，雙方矛盾白熱化。同治十二年漕糧海運結束後，李鴻章接到了江浙沙、寧船號商鬱森盛等人的請願書，書中提及沙、寧各船曆年來都是勤勤懇懇，報效朝廷，現在生計日蹙，唯存漕糧海運這一線希望，商人們懇請朝廷每年能夠撥給他們裝運漕糧100萬石。李鴻章把難題拋給了江蘇巡撫張樹聲，而張樹聲的回複是：本年應運的漕米有110餘萬石，應該先盡沙船裝載。
招商局“豐順號”輪船
這絕非李鴻章的本意，在他的授意下，招商局迅速進行反擊。朱其昂等人通過蘇鬆太道沈秉成向張樹聲請願，指出本年不但不能壓縮輪船招商局所運漕糧數額，反而應該予以增加。他們認為沙、寧等船困苦凋敝，“恃運漕為養命之源”，但輪船招商局創辦伊始，也是以運漕為立足之基。同治十三年江蘇的漕米一共65萬石，應仍按“沙八輪二”的比例，即由沙、寧船分運52萬石，輪船運13萬石。也就是說，應較去年多派3萬石給招商局。後來，署布政使應寶時、糧道英樸等人經過商議，決定將沙、衛等船的運載量一律折減，從中提出漕糧正米3萬石，並隨同商耗2400石，撥歸招商局承運。事後，統計這一年輪船招商局所運江蘇之米，共11餘萬石，與上年基本持平。可見輪、沙雙方都做了讓步。
雖然這場輪、沙之間的鬥爭最終以和局收場。但是不難發現，洋務派創辦招商局，最主要的原因乃是借漕糧海運之名，以興辦洋務運動之實。而沙船業的衰退固然影響了漕糧海運的發展，但是至少在光緒初年以前，沙船並非不敷，而是還有剩餘。輪船招商局參與到漕糧海運之中來，對傳統的木帆船業造成巨大的衝擊。麵對處於優勢地位的輪船，木帆船欲作最後一搏，故煥發出很大的活力。可是，為了在競爭中獲得一席之地，木帆船主將希望寄托於官方的政策傾斜和扶植上，而不通過改造自身來謀求發展，這也預示著它不可避免被淘汰的命運。