近幾年來，高校文物類資產管理的質量不高，方法落後，基礎工作薄弱，規章製度不健全，崗位責任不明確，會計監督和核算不力，造成國有資產有形與無形流失嚴重，具體表現在以下幾個方麵。
（一）高校文物類資產“底數”不清，賬目混亂
高校作為一個傳承文化的場所，在漫長的辦學過程中逐步形成了一定量的高校文物資產。由於建校曆史長，藏品來源渠道龐雜，人員變化頻繁等客觀原因，高校文物類資產“底數”不清。在文物及陳列品固定資產的認定上相關的製度和文件不全，校內固定資產認定的流程之間銜接並不緊密，容易在會計賬麵上沒有得到及時的確認，甚至是重複入賬。長期以來，藏品管理不規範，人治管理，各管一攤，由於缺乏必要的、細致的交接手續，人員發生變動時，其他人就不清楚庫存情況。
（二）對文物類資產進行清查盤點存在局限性
高校進行文物類資產清查盤點存在不好操作的問題。《文物事業單位財務製度》規定：“財務部門應當定期與保管部門進行文物資產清查盤點，重點要核對文物藏品資產賬麵數、文物藏品登記賬數和實物，確保文物藏品的數量、名稱和實物一一對應。”該款規定難以執行。對文物類資產進行清查盤點，盤點人要具備一定的文物專業素質，要非常清楚藏品情況。但高校資產管理人員不是文物專業技術人員，其掌握信息不足，如此一來，建立健全文物藏品的監督管理製度就會打折扣，而要求其定期進行文物類資產清查盤點基本上也做不到。
（三）高校文物類資產保管不專業，內控製度不完善
很多高校對藏品的保管措施不科學，沒有根據藏品的種類、級別、質地等，采取不同的保護和管理措施，而是對所有的藏品都使用一種方式，這不利於藏品的保護和管理。金屬腐蝕，石雕風化，木材幹裂，紙張老化等，也是造成資產流失的客觀內容之一。高校普遍缺乏文物的內部控製製度。內部控製製度是一種防範製度，可以使相關部門相互牽製，如果不建立和執行內部控製製度，可能會出現拿錢拿物甚至貪汙的情況。