教材除了承載知識，還要體現學習認知的過程，滲透教學的思路。然而，紙質教材局限於平麵化的紙質載體，內容呈現缺乏層次，“一覽無餘”。盡管為了引導學生主動學習，體現認知發展的過程，教材編寫者希望將諸如實驗現象、探究結論等內容暫時隱藏，讓學生在不受幹擾地情況下，通過思考、鑽研得出自己的答案，然後再“揭曉謎底”進行核對。換言之，紙質教材允許對內容呈現的選擇隻有“有”或“無”，沒有“先”和“後”。在教材使用時，當教師在正式教學之前想讓學生通過閱讀教材進行自學，卻由於學生提前知曉了結論，學習的新奇感、趣味性大大降低，學習探究實踐活動常常淪為走過場、走形式，學生的學習變得“隻唯書、隻唯上”。這種狀況嚴重妨礙了學生的觀察、思考、質疑和創新。
除此之外，教材內容之間缺乏直接的關聯性，不能進行快速檢索和通過鏈接進行跳轉，查找特定的內容會費時費力。除了妨礙閱讀和降低學習效率，也不利於學生對相關知識進行整合使之係統化。