1.填製憑證
記賬憑證產生的方式包括人工輸入、自動轉賬、其他子係統轉入。企業應設計好每類憑證產生的方式，防止出現重複和遺漏等情況。手工輸入時必須注意輸入日期、會計科目編碼等。
2.審核憑證
憑證錄入後要進行審核，包括自動審核和人工審核。自動審核是計算機按照程序進行的校驗，有些內容計算機無法校對就需要人工校對。人工審核的內容主要包括：附件張數、金額內容是否與記賬憑證一致、科目是否正確等。審核完畢必須由審核員簽字蓋章。
3.記賬與結賬
為防止記賬過程由於異常中斷而導致數據丟失，記賬前必須進行數據備份。然後由有記賬權限的操作員登記賬簿，整個過程處於自動化狀態。一些會計軟件提供了反記賬功能，這些功能不得隨意使用，必須嚴格規定操作權限，經主管領導批示後才能使用。
結賬是由結賬權限的操作員發出結賬指令，係統自動把當月期末餘額結轉到下月，結轉後不能錄入當月憑證。
4.賬簿信息輸出
賬簿信息輸出有查詢、打印等方式。電算化係統中的信息輸出內容靈活，可以按具體條件查詢，凡是能查詢到的內容都可以打印出來。打印的方式有套打和非套打兩種。套打是指打印時打印機將輸出的數據打印在已有格式的打印紙上，這種方式打印容易錯位，必須使用專用紙張。非套打是指打印時將憑證和賬簿格式連同數據一起打印到空白打印紙上，這種方式不會錯位，但是打印時間比較長。
5.係統維護
電算化係統下，在做好初始化和日常處理工作的基礎上，為保證數據的安全，還應做好相應的數據維護，如數據備份、數據備份等。