瘧疾是由瘧原蟲引起的蟲媒寄生蟲病，以周期性的寒戰、高熱、大汗、脾腫大、貧血為特征。主要通過蠅蚊傳播。感染人體的瘧原蟲主要有四種：間日瘧原蟲、三日瘧原蟲、惡性瘧原蟲和卵性瘧原蟲。在現代，江南地區較為多見的為間日瘧，其他瘧較少見。[111]瘧疾的名稱很古老，起自《素問》。不過如上文已經指出的，瘧疾在較長時期內並不僅僅指現代醫學中的malaria，還包括一切寒熱交作之類的疾病。自元明以後認識逐漸清晰。在清代的江南，瘧疾無疑是一種常見病，這從清人文集中不時可見的所謂“驅瘧文”不難看出一二，比如，清初的金德嘉在一篇文章中是這樣開頭的：“丁巳之歲冬十月壬申病痞，十有一月甲戌、丙子劇，餘乃焚香危坐，捉筆為文，童子汲宋井水灑以桃茢而驅之。”[112]蘇州的諸人獲則在《祛瘧鬼咒》中雲：“一日瘧堙迦醯迦，二日瘧墜帝藥迦，三日瘧怛墜藥迦，四日瘧者特托迦。不計數，不住口，持一晝夜，瘧鬼遠避疫一由旬。”[113]不少文人還常作詩生動敘述患瘧的痛苦，比如，錢塘金張曾作《盛暑蔗勞病瘧感記二首》，其中一首為：
人生苦樂無不試，
隻有死時未得知；
今日得君爭必死，
想來不異在生時。
（每一熱必力爭必死——原注。）[114]
正是因為瘧疾的多見，所以有些民俗也常常與瘧有關，比如，也在常熟：
風俗四五歲下之孩童，第一次患瘧疾，謂之胎瘧，須由外祖母家遣人來，向家灶上祭祀一番，病始得痊。其祭祀之法，由外家備灶馬二個、香燭阡阮、素盤水果、糕餅等物，遣人持至病家灶間，須一徑走入，不能和人接談，將兩灶馬背與背相接，置諸大鑊蓋上，各種祭品，陳列於前。祀畢，將灶馬與阡阮焚化，攜餅一個，直向外走，亦不得與人接談。 口中但雲：我以後不再來了。既出門，將所攜之餅，擲飼犬。其意若曰：將病傳之於犬也。祀灶所餘之物，亦須立時食盡。蓋謂吃得快，好得快也。[115]