北平商民協會與北平商界上層的第二次衝突，因瑞蚨祥等商號反對商民協會成立店員公會而起。
在與總商會因征收五個月鋪捐爭論的同時，商民協會緊鑼密鼓地開始健全組織。原來商民協會隻有總的機構，沒有下屬分支機構，而按照1928年7月19日國民黨中常會第157次會議通過的《商民協會組織條例》，商民協會應下設商人、店員、攤販三個總會，其代表大會的代表總額為12～120人，三總會代表比例為5∶4∶3。[46]商民協會已估計到店員總會因涉及與店主的關係，恐不易組織，但也在積極推進，並已在瑞蚨祥等商號組織了分會，計劃在舊曆年內（1929年2月9日前）組織成立總會。[47]
商民協會組織店員公會的消息使商店店主極為不安，他們紛紛要求市政府和北平政治分會禁止店員公會的成立。北平地方當局又一次倒向了商人方麵，市政府社會局致函市黨部民訓會，稱正值訓政時期，店員應否成立團體，請加以慎重考慮。民訓會複函解釋了成立店員公會的依據和意義。社會局於1929年1月23日將民訓會複函抄送瑞蚨祥密閱，民訓會得知後，深為不滿，認為社會局不無勾結奸商破壞民眾團體之嫌，於24日致函市政府，請其查究，並將這一情況呈報中央。[48]
北平政治分會對市黨部主導成立店員公會也極為不滿，但它隻有監督地方政府之責，地方黨部與它沒有隸屬關係，遂於1月21日向國民政府請示處置方針，聲稱，“查平津各商，以鑒於前年武漢店員工會之橫暴，談虎色變，忽聞平津發生此項組織，紛紛來會陳請禁止，本會查省黨務指導委員會服務規則第三條第一項所載雲，中央未頒布民眾訓練具體方案以前，關於民眾運動，須經中央之許可，此次店員工會，應否設立，自不能不請示中央”。政治分會此電故意將“店員公會”寫成“店員工會”，雖僅一字之差，含義卻大不一樣，因為組織店員公會是國民黨中央民訓會頒布的《商民協會組織條例》明文規定的，政府自無阻止它成立的理由。而將店員公會納入工會係統，國民政府自可以借口工會法規尚未頒布而禁止它成立。國民政府當然知道北平政治分會此電中的“工會”並不是無心之誤，在23日的複電（漾電）中也就順水推舟地給店員公會畫上了休止符：“查工會法規，尚待審查，店員工會既多流弊，應暫飭禁止成立，免滋糾紛。”[49]