根據綜合高中人才培養目標的多元性、課程類型與內容的多樣化，相關部門應鼓勵學校積極探索分層與分類相結合課程實施模式。分流前按能力分班、分流後按類型分班、跨班跨年級和跨校的分層與分類教學多等種方式，為開展富有針對性的教育教學、合理而有序地落實各類課程提供保證。
綜合高中設置四個課程模塊：基礎課程、學術課程、技術課程和拓展課程。基礎課程要滿足高中畢業會考的基本要求；學術課程要建立分層機製；技術課程要根據職業領域分類；拓展課程包括興趣輔導、生活輔導、升學指導或就業指導等內容。根據綜合高中的辦學特點，高一年級安排公共必修類基礎課程；高二年級按照學術類和技術類分模塊安排課程，學術類和技術類課程分為必修和選修兩個類別，互通互選。學術類學生要修技術類學分，技術類學生要修學術類學分。高三重點開展拓展類課程，主要是升學指導或就業指導類課程。
學校在保證開設所有必修課程模塊的同時，要積極創造條件，製定開設選修課程的規劃，構建豐富、多元的課程體係，為學生的綜合發展、個性成長提供豐富多彩的、高質量的選修課程。
學校要建立以行政班和學生個體為單位的課程實施機製，在條件許可的情況下，逐步建立以學生個體為單位的課程實施機製，鼓勵每個學生根據自己的個性興趣和學習習慣製訂專屬於自己的課程方案。