如果我們堅持社會科學的學科獨立性，就不得不麵對在社會科學和自然科學的統一與分化之間形成的張力，這是當代社會科學哲學必須關注和解決的一個核心議題。知識的整體性是二者統一的理論基礎，但它們又在研究對象、方法和模式上存在顯著的差異。為了正確對待社會科學和自然科學之間的對立與融合，我們有必要重新審視自然科學範式之於社會科學研究的適用性。適用性問題分析是研究科學思維和方法跨學科應用的邏輯前提。
縱觀整個社會科學發展史，不論是牛頓力學還是達爾文進化論，借鑒和模仿自然科學範式已然成為社會科學維護其科學合法性的有力途徑。近年來，發端於各門自然科學學科的“複雜係統範式”[73]，在社會科學領域中的應用不斷擴張，其所倡導的科學世界觀、認識論和方法論引起了社會科學（哲學）家的廣泛重視。然而，對於複雜係統理論和方法是否適於介入社會科學研究，學界存在兩種截然不同的態度：一些學者倡導借助複雜係統範式來解決傳統社會科學研究所麵臨的各類困境[74]，另一些學者則表達了對其適用性的懷疑[75]。值得注意的是，不論是支持還是反對複雜係統範式的跨學科應用，國內外學界並未對其適用（或不適用）的層次和範圍給予足夠重視。支持應用的學者僅在宏觀上將其視為探索新的社會科學研究形式的有效進路；反對應用的學者則把其不適用性簡單歸結為社會科學與自然科學研究範式的不可通約。正是在這一背景下，本章嚐試在社會科學與自然科學研究對象所具有的同質性的基礎上，分析並揭示複雜係統理論和方法適用於社會科學研究的具體層次和維度。
通過剖析社會係統的複雜適應性本質，重構社會科學的認知模式，進而推動社會科學方法論體係的發展，不僅有助於澄清複雜係統範式核心的研究思維、理論基礎、實踐規範和方法等，及其在具體的社會科學研究主題中的適用層次及其適用度，而且，交叉研究的成果也可以進一步豐富和深化複雜性理論本身。因此，這並不是用自然科學來取代社會科學，也不是社會科學對自然科學範式的盲目照搬，更不是妄想在複雜係統科學的基礎上建立包括社會科學和自然科學在內的大一統科學，而是嚐試跨越學科專業化的鴻溝，以跨學科和全學科的研究模式來整體推進社會科學研究模式的革新。