神宗範天合道哲肅敦簡光文章武安仁止孝顯皇帝，諱翊鈞，穆宗第三子也。
母貴妃李氏。隆慶二年，立為皇太子，時方六歲。性岐嶷，穆宗嚐馳馬宮中，諫曰：“陛下天下主，獨騎而騁，寧無銜橛憂。”穆宗喜，下馬勞之。陳皇後病居別宮，每晨隨貴妃候起居。後聞履聲輒喜，為強起。取經書問之，無不響答，貴妃亦喜。由是兩宮益和。
六年五月，穆宗崩。六月乙卯朔，日有食之。甲子，即皇帝位。以明年為萬曆元年，詔赦天下。祀建文朝盡節諸臣於鄉，有苗裔者恤錄。庚午，罷高拱。丁醜，高儀卒。壬午，禮部尚書呂調陽兼文淵閣大學士，預機務。秋七月丁亥，初通漕運於密雲。庚寅，察京官。己亥，戒諭廷臣，詔曰：“近歲以來，士習澆漓，官方刓缺，詆老成為無用，矜便佞為有才。遂使朝廷威福之柄，徒為人臣報複之資。用是薄示懲戒，餘皆曲貸。諸臣宜祓除前愆，共維新政。若溺於故習，背公徇私，獲罪祖宗，朕不敢赦。”庚子，尊皇後曰仁聖皇太後，貴妃曰慈聖皇太後。八月戊午，祀大社大稷。九月甲午，葬莊皇帝於昭陵。冬十月己未，侍郎王遴、吳百朋、汪道昆分閱邊防。辛酉，停刑。十一月乙未，河工成。十二月辛酉，振榆林、延綏饑。甲戌，以大行未期，罷明年元夕燈火及宮中宴。
萬曆元年春二月癸醜，禦經筵。三月丙申，詔內外官舉將材。夏四月乙醜，潮、惠賊平。庚午，旱，諭百官修省。五月甲申，詔內外官慎刑獄。六月壬申，振淮安水災。秋七月，河決徐州。九月癸未，振荊州、承天及濟南災。丙戌，四川都掌蠻平。癸卯，停刑。冬十一月庚辰，命諸司立程限文簿，以防稽緩。十二月己未，振遼東饑。是年，暹羅、琉球入貢。
二年春正月甲午，召見朝覲廉能官於皇極門。二月甲寅，振四川被寇諸縣。