穆宗契天隆道淵懿寬仁顯文光武純德弘孝莊皇帝，諱載垕，世宗第三子也。
母杜康妃。嘉靖十八年二月封裕王，與莊敬太子、景恭王同日受冊。已而莊敬薨，世宗以王長且賢，繼續已定，而中外危疑，屢有言者，乃令景王之國。
四十五年十二月庚子，世宗崩。壬子，即皇帝位。以明年為隆慶元年，大赦天下。先朝政令不便者，皆以遺詔改之。召用建言得罪諸臣，死者恤錄。方士悉付法司治罪。罷一切齋醮工作及例外采買。免明年天下田賦之半，及嘉靖四十三年以前逋賦。釋戶部主事海瑞於獄。是年，土魯番入貢。
隆慶元年春正月丙寅，罷睿宗明堂配享。戊辰，複鄭王厚烷爵。丁醜，追尊母康妃為孝恪皇太後。二月戊子，祭大社大稷。乙未，冊妃陳氏為皇後。吏部侍郎陳以勤為禮部尚書兼文淵閣大學士，禮部侍郎張居正為吏部左侍郎兼東閣大學士，預機務。三月壬申，葬肅皇帝於永陵。乙酉，土蠻犯遼陽，指揮王承德戰歿。
夏四月丙戌朔，享太廟。丙午，禁屬國毋獻珍禽異獸。丁未，禦經筵。五月己未，黃河決口工成。辛酉，祀地於北郊。丁醜，高拱罷。六月戊戌，以霪雨修省，素服避殿，禦皇極門視事。是月，新河複決。秋七月辛巳，招撫山東、河南被災流民，複五年。八月癸未朔，釋奠於先師孔子。九月乙卯，俺答寇大同，詔嚴戰守。
癸亥，俺答陷石州，殺知州王亮采，掠交城、文水。壬申，土蠻犯薊鎮，掠昌黎、盧龍，至於灤河。詔宣大總督侍郎王之誥還駐懷來，巡撫都禦史曹亨駐兵通州。
甲戌，郭樸致仕。免襄陽、鄖陽被災秋糧。乙亥，總兵官李世忠援永平，與敵戰於撫寧，京師戒嚴。冬十月丙戌，寇退，京師解嚴。甲辰，諭群臣議邊防事宜。
寧夏總兵官雷龍出塞邀擊河套部，敗之。十一月癸亥，祀天於南郊。是年，廣東賊大起。琉球入貢。