寫完《塵埃落定》後，阿來全身心地投入到了雜誌的運營中：組織選題、策劃活動、推廣發行。不僅與國內媒體合作，還引入國際項目合作。諾貝爾獎金獲得者、環繞太空的宇航員、國外科幻作家先後被請到中國，阿來的《科幻世界》引起了國際科幻界的注意。
2000年，阿來已由編輯做到總編輯、社長；雜誌發行量也由幾萬到幾十萬；雜誌數量由一本衍生出六七本；領域由刊物、書籍擴展到音像製品。不到三年，就做成了產業。據稱，在世界科幻類雜誌發行量中，《科幻世界》名列榜首。
最近阿來的科幻“產業”又延伸到心理學，阿來說他正在做一本這方麵的雜誌。他的事業一如這個時代令人眼花繚亂。兩年前，阿來一度想把雜誌經營與資本市場聯結起來，與四川幾家媒體聯合成立了科技傳媒股份公司。他不甘於簡單的雜誌發行，想讓科幻世界在中國形成真正的市場。他看到了一個巨大的發展空間。
到了這個階段，阿來的閱讀已經很挑剔了。最近他讀當代小說少了，同一層麵的東西已經讀得差不多了。“好像讀到一定程度上，大致的東西有了了解，讀這方麵的書興趣小了。由於工作需要，文學方麵書讀得少。現在的文學是要把人弄瘋，濫用語言、濫情，也是我不願讀的原因。我現在主要讀科學、曆史、宗教方麵的書，讀得很雜。”
阿來不讀二手的評述。宗教也有基本經典，佛經雖有不同流派，但經典就幾部，他是讀原書、經書。他重視閱讀給他的感受，也重視文化源流的東西。
阿來現在閱讀更多的是中國古代文學，他在春節期間買了幾十本這方麵的書，“我這次是全麵閱讀，從漢代開始，樂府詩、賦什麽的。我特別喜歡中國的筆記小說，魏晉、明、清，我收了不少，讀了不少。是啊，好的不多，但有些可以反複閱讀。它們的故事都講得很有意味。”