第一，改革遇到的敵人太強大了，這包括：阿蒙神廟祭司、其他神廟祭司、地方貴族（包括許多諾馬爾赫），以及其他依附於神廟、與神廟有聯係、其利益與神廟有關的一些階層或集團。尤其是阿蒙神成為全國崇拜的主神已有幾百年的時間，在精神上統治了埃及，其影響是很大的，一旦這一切被否定，必定會讓人們在感情上難以割舍。改革進行得十分激烈而迅速，人們對舊的信仰未完全拋棄，而新的也未完全熟悉。因此，倡導改革的國王一死，改革的主要推動力便消失了，改革也就進行不下去了。
第二，改革派內部的分裂，削弱了改革的力量。分裂的原因是多方麵的：阿蒙神廟祭司的壓力，使一部分人動搖，放棄改革。王室家族內部的分裂，提伊王後對改革的態度對改革無疑影響很大。相當一部分軍事行政奴隸主放棄了改革，其原因很大程度根源於阿蒙祭司的壓力。改革期間停止了對外戰爭，因而他們掠奪不到新的土地、奴隸及財富，得不到戰利品。埃赫那吞對屬地的不聞不問，使許多屬地喪失，也引起奴隸主的不滿。
第三，改革所依靠的階級基礎——新興的中小奴隸主涅木虎，發展緩慢，力量十分弱小。他們不僅人數少，且經濟實力、政治思想上的影響和號召力還遠不如祭司奴隸主。這是埃及奴隸製經濟基礎發展不充分的反映。雖然新王國時期是埃及奴隸製經濟走向繁榮的時期，但由於王室、神廟和官僚貴族奴隸主控製了大部分生產資料，使得新興奴隸主得以生存和發展的空間過於狹小。埃及商品貨幣關係的不發達，也不足以瓦解貴族們的經濟，不能為新興奴隸主的發展開拓出廣闊的道路。可以說，古代埃及的新興奴隸主（包括中王國時期的涅傑斯和新王國時期的涅木虎在內），是在王室經濟、神廟經濟及貴族奴隸主經濟的縫隙中生長和發展起來的，他們之間既有衝突，又有千絲萬縷的聯係，新興奴隸主可能在某些方麵還要依賴於這形形色色的貴族奴隸主經濟，這就是它的軟弱性所在。例如，許多手工業者、商人寄生於神廟經濟。因此，新興的中小奴隸主是很軟弱的，不可能同貴族們進行頑強而堅決的鬥爭，一部分涅木虎甚至可能也放棄了改革。