獨立的喪失，土地被剝奪，沉重的賦稅負擔、勞役和兵役，必然會激起兩河流域人民的反抗鬥爭。公元前522年，在當岡比西斯在埃及時，在波斯國內發生了推翻岡比西斯統治的事件，最後大流士攫取了王權。這時兩河流域人民和波斯統治下的其他地區人民掀起了反對大流士統治和波斯人統治的鬥爭。在大流士的《貝希斯吞銘文》中說：
當岡比西斯向埃及出發的時候，人民**起來，在國內，在波斯，在米底，也在其他各省，發生了巨大的惡禍。以後出現了一個人，僧侶瑪哥斯，名高墨塔，他在庇什亞瓦德，在名為阿爾卡德裏什山的地方暴動了……於是所有的人民，波斯、米底以及其他諸省都**起來，從岡比西斯轉而傾向於他。
在大流士奪取了王權以後，包括巴比倫在內的各省人民再次起義反對波斯人的統治。在《貝希斯吞銘文》中說：
當我殺死了僧侶高墨塔之時，有一個人，名阿辛那，烏帕達爾馬之子，在埃蘭暴動了……還有一個巴比倫人，名尼金圖·貝爾，阿尼裏之子，在巴比倫暴動了。他這樣欺騙人民說：“我是尼布甲尼撒，那波尼德之子。”這時巴比倫人民全部轉向這個尼金圖·貝爾。巴比倫**起來了，而他在巴比倫取得了政權……此後，我向巴比倫出發攻打自稱為尼布甲尼撒的尼金圖·貝爾。尼金圖·貝爾的軍隊占據了底格裏斯河。他的軍隊停在那裏，船隊也就停在那裏。於是我令軍隊坐在皮筏上，另一部分坐在駱駝或馬上。阿胡拉·馬茲達幫助了我。按阿胡拉·馬茲達的意旨，我們渡過了底格裏斯河。在那裏粉碎了尼金圖·貝爾的軍隊。這是在阿西亞吉加月二十四日，我們進行了會戰。此後，我前往巴比倫。在未到達巴比倫之前，在幼發拉底，那裏有一個名為紮讚那的城市，那個自稱為尼布甲尼撒的尼金圖·貝爾帶領軍隊來到這裏，要與我會戰。以後我們進行了戰鬥。阿胡拉·馬茲達幫助了我。按阿胡拉·馬茲達的意旨，我粉碎了尼金圖·貝爾的軍隊。敵人被趕入了水中。水把它帶走了。這是在阿那馬卡月二日，我們進行了會戰。尼金圖·貝爾帶領少數的騎兵逃到巴比倫。於是我開往巴比倫。按阿胡拉·馬茲達的意旨，我占領了巴比倫並擒獲了尼金圖·貝爾。以後我把這個尼金圖·貝爾殺死在巴比倫。