高加美拉在古亞述首都阿淑爾附近，大流士三世在這裏集結了號稱百萬大軍（實際上不過八萬左右，其中包括兩百輛配備有彎刀以對付方陣的戰車和十八頭大象），準備和亞曆山大再次進行會戰。為了自己的戰車和騎兵能發揮威力，大流士三世命令把高低不平的地方鏟平。據阿裏安的記載，會戰時雙方軍隊的部署情況如下：
大流士的軍隊左翼是巴克特裏亞騎兵，和他們在一起的有達海人、阿拉科提亞人。和他們並排的部隊是波斯騎兵混編部隊。波斯人後麵是蘇西亞人，最後是卡杜西人……右翼是敘利亞、美索不達米亞部隊、還有米底人。在他們後麵是帕提亞人、塞種部落，然後是塔普裏亞人、赫卡裏亞人，再往後是阿爾巴尼亞人、塞克西尼亞人……在大流士國王全軍中央，有親王、波斯人、‘蘋果手’（按：波斯國王的侍從，因其長矛尾部刻有蘋果狀物而得名）、印度人、號稱‘移民’的卡裏亞人、馬爾吉安那弓箭兵。攸可西亞人、巴比倫人、紅海各部族人及西塔刻尼亞人組成軍隊的縱深。在左翼之前，正對著亞曆山大右翼的地方部署有西徐亞騎兵、約1000名巴克特裏亞人和100輛刀輪戰車。在大流士王家中隊旁邊還部署了象隊和50輛戰車。右翼的前方部署了亞美尼亞、卡帕多細亞騎兵及50輛刀輪戰車。希臘雇傭兵部署在大流士身邊的波斯人兩側，他們部署在馬其頓方陣對麵，他們是唯一能夠對付這個方陣的部隊。亞曆山大軍隊部署如下：右翼是重裝騎兵團。左翼馬其頓軍隊有亞曆山大之子克拉特拉團，他同時又是左翼所有步兵的指揮官。和該團並排的有拉裏卡斯之子埃裏吉亞指揮的盟軍騎兵。左翼和他們並排的還有邁尼勞斯之子菲利普指揮的帖撒利亞騎兵。整個左翼由菲羅塔斯之子帕紐曼指揮。他身邊有帖撒利亞騎兵，他們是帖撒利亞騎兵的精華和多數。