波拿巴在埃及的冒險和他在意大利的征戰完全一樣，是法國革命曆史上的一個轉折點。這次征戰把共和國最優秀的部隊派往遠方。然而對英鬥爭還在繼續，大陸和平很不穩定。因此，它是不符合民族利益的。直到那時為止，革命的法國對東方事務是不感興趣的。自從1796年占領開普敦以來，英國一直自詡為通往印度道路的主人，這時它又發現了蘇伊士通道的重要性。土耳其和俄國先後開始不安。於是組成了這3個列強的聯盟，這是走向第二次反法聯盟的第一步。
4.第二次反法聯盟（1798—1799年）
第二次反法聯盟的組成（1798年4—12月）是歐洲對督政府侵略政策的反擊。在好幾個月裏，英國一直力圖在大陸上為法國樹立一個新的敵人。沒有它，英國不可能對法國予以決定性的打擊。東方和意大利發生的一些事件給它造成了這個機會。
埃及事件促使俄國和土耳其向英國靠攏。土耳其於1798年9月9日向法國宣戰。在俄國，半瘋子保羅一世繼承了葉卡特琳娜二世的王位。他對法國革命懷有刻骨仇恨，因此接納了王位僭望者路易十八，把他安頓在米托。特別是他重新實行向地中海的擴張政策。反法鬥爭使他同土耳其言歸於好。根據1798年12月23日的條約，土耳其向俄國開放它的港口和海峽。一支俄國艦隊進入地中海，並奪取了愛奧尼亞群島。1798年12月29日，英國、那不勒斯和俄國結成聯盟，決定在意大利進行幹預。
恰好羅馬事件在半島上又點燃了戰火。在納爾遜的鼓動下，那不勒斯的君主費迪南三世和親英的瑪麗-卡羅琳娜向羅馬共和國發起進攻。1798年11月26日，那不勒斯部隊在奧地利將軍馬克指揮下攻占了羅馬。督政府對此予以反擊，首先占領了皮埃蒙特，因為它的國王是英國人公開的間諜。然後，尚皮奧奈發起進攻，並於1799年1月23日解放羅馬，奪取那不勒斯。國王和王後乘坐英國戰船逃往西西裏。那不勒斯遭到一場浩劫。雖然督政府指示把那不勒斯留作未來談判的籌碼，尚皮奧奈仍然在那裏建立了帕泰諾普共和國。這時普魯士恪守中立。奧地利經過一陣猶豫，在俄國準備好幹預意大利時下定了決心。它同意俄國部隊通過自己的領土。鑒於這一形勢，督政府於共和七年風月22日（1799年3月12日）向奧地利宣戰。它立即出兵占領了托斯卡納，並把教皇遷往瓦朗斯。