一般傳染病，病人是主要的傳染源，隔離是把傳染病人與健康人分開，杜絕傳染機會，以限製和撲滅傳染病的蔓延。這在傳染病的管理上有極重要的意義。許多傳染病都是在早期傳染性最強，所以早期隔離病人是控製傳染病流行的重要環節。但是，在最早期要想確診疾病是有一定困難的，因此如有可疑病兒，即使當時不能確診，也應將其隔離。
（一）對患兒的隔離
一旦發現患傳染病或有可疑病者，應迅速將其與健康兒童隔離。隔離應有單獨的房間或隔離室。隔離後的患兒應有專人細心護理、治療，按時給病兒吃藥、測體溫、詳細記錄病情，並合理安排他們的生活與飲食，這不僅能防止傳染病的蔓延，還能使病兒得到個別的照顧，有利於健康的恢複。
患不同傳染病的病人，應分別隔離，以免相互傳染。如麻疹的病原體是病毒，而猩紅熱的病原體則是乙型溶血性鏈球菌。如果不分開隔離，交叉感染，既患麻疹，又患猩紅熱，那很危險。
隔離室的工作人員要固定，不串班，不與健康兒童接觸，不進廚房，進入隔離室要戴口罩，穿隔離衣，離開隔離室時要脫去隔離衣，並用來蘇水或肥皂仔細洗手。
隔離室的玩具、用具，必須單獨使用，並定期消毒。病人吃剩的東西，絕對不能再讓別人吃。照顧健康班的工作人員不能進隔離室。對患兒的隔離時間應嚴格按各傳染病規定的期限。
（二）對接觸班的隔離
對接觸班的隔離是將與急性傳染病患兒所在的班和其他未接觸病人的兒童隔離，直到該傳染病最長潛伏期終了時再無新患者發現為止。其主要目的有兩個：一是有利於密切觀察早期症狀，早期發現續發患者以便管理；二是切斷傳染途徑，使以後再有患者和帶菌者出現，也不致危及已隔離的易感者。對接觸班的兒童要進行醫學觀察，並采取必要的防治措施。觀察他們的飲食、精神、大小便、體溫等是否異常，安排好一日活動，適當增加營養，並隨時將護理觀察的情況告知醫生，打預防針，服預防藥，達到有病醫治、沒病防病的目的。就是傳染上了疾病，也可減輕患兒的症狀，縮短病程，加速康複。觀察期間，接觸班不收新生入園，不混班，不串班，做到分散活動，以縮小傳染範圍。盡量使傳染病的流行終止在一個班上。除此之外，還應對接觸班進行徹底消毒。