自願戒毒作為與社區戒毒、強製隔離戒毒、社區康複戒毒並存的戒毒措施，經長期不斷的實踐摸索，體現出它獨有的應用效果，當然也暴露了它存在的問題和不足之處，需要加以解決並不斷發展，以更好地發揮它在戒毒工作中的作用。
一、自願戒毒的應用效果
（1）吸毒者通過戒毒醫療機構進行戒毒治療，往往是自行交費，從而有利於在一定程度上減輕強製戒毒、社區戒毒或社區康複的壓力，減少國家在禁毒戒毒方麵開展工作投入的人力和財力。
（2）有利於鼓勵隱性吸毒者自行進行戒毒。我國除卻已登記在冊的龐大吸毒群體之外，仍有相當一部分吸毒人群未曾登記在冊，此類人群不願暴露自己的吸毒行為，通過自願戒毒可以滿足其不被他人知曉的心理狀態，從而幫助其走入戒毒醫療機構進行自我戒毒。
（3）戒毒醫療機構的醫療隊伍專業能力較強，更能通過先進的醫療方法對戒毒人員進行戒毒治療，更能體現科學戒毒的立法宗旨。
二、自願戒毒存在的不足之處
（1）戒毒費用過高，許多戒毒者無法承擔。自願戒毒醫療機構對自願戒毒者的戒毒治療是收取費用的，這些費用往往是由戒毒者或其親屬自行承擔。有的戒毒醫療機構變相謀取利益，收取過高費用，而吸毒人員大多本身因為前期的吸毒行為已經耗費了大量的錢財，如因自願戒毒而需交納過高費用，很大部分戒毒者都會因無法承擔巨額的費用而選擇放棄。
（2）戒毒醫療機構的戒毒治療往往側重於脫毒治療而忽視心理康複和社會功能的恢複。自願戒毒的治療內容包括生理脫毒、心理康複和社會功能三項內容，而戒毒醫療機構由於其具有的營利性、場所範圍有限、治療隊伍以醫療隊伍為主，缺乏心理谘詢師、技能培訓師等特點而導致其治療重點僅在於幫助戒毒人員脫離生理毒癮，而對於另外兩項則基本忽視，即使有所涉及，也是淺嚐輒止，不能夠深入開展。