馬克思主義的當代發展要求也造成了研究方式的變化。馬克思主義哲學研究方式在這個時段發生了重大的轉換，這個轉換可以從以下方麵來理解。
1.由概念演繹轉向關注生活世界
在過去相當長的時期裏，我國的哲學理論工作者處於主要解讀原著和注釋經典的尷尬境地，其主要任務是解讀和闡發馬克思主義基本原理，闡釋那些已經被大家熟悉的理論命題，或使之具體化，在馬克思主義哲學的領域內部作一些修補性和細化性的理論探討，尋求一種邏輯的自洽。這種研究總體上看處於自我循環的境地，以致有人說哲學工作者們常常是自言自語、“自食其果”和自我欣賞，難以有實質性的研究與創新。改革開放以來，思想理論界空前活躍，一方麵通過清理概念，澄清命題，重釋理論，開拓領域，創建學科等，為深層的理論研究奠定了必要基礎；另一方麵通過大量翻譯和評介國外學術思潮而了解了世界思想理論前沿和學術發展方向，為自主的哲學理論研究提供了背景性條件。在此基礎上，我國的理論工作者前所未有地深入到當代中國的社會生活和社會實踐之中，關注自然世界、社會世界和人性世界的變化，進一步走進了人們的生活世界、文化世界、心靈世界，與曆史與現實開展對話。理論工作者們通過關注對象的變化來促進理論自身的變化，從對象世界的變化中獲得了最為豐富的資料，也獲得了前所未有的思想活力。
2.由高居於科學之上到走入大科學之中
過去人們把馬克思主義哲學看作科學的科學，將其高置於一切科學之上，難以深入到科學之中。由此既難以從科學中吸取營養，也難以指導科學的發展。30多年來，馬克思主義研究前所未有地自覺借鑒科學成果與思想方法，走進現代大科學和大技術。馬克思主義哲學不僅要幫助人們科學地認識和解釋世界，還要幫助人們合理和有效地變革世界，去創造屬於人的美好世界，這就需要現代科學技術的支撐。為此馬克思主義哲學研究前所未有地與科學結盟，自覺地借鑒現代自然科學，包括人文社會科學的成果，尤其是自覺運用和提升一些跨學科的方法論：從當年馬克思主義哲學與信息論、控製論、係統論“老三論”的結合，後來進一步與耗散結構、循環論、突變論“新三論”結合，直至今日與現代係統科學和複雜性科學群的對話。正是借助於複雜性科學的理論、思路和方法，馬克思主義哲學獲得了一種特殊的能力，能夠從事對於複雜性問題的深度解讀和批判性反思，並在人類實踐中發揮更加積極和有效的作用。