章太炎被羈押後，一直被關在四馬路老巡捕房的樓上。由於是租界負責管理，各方麵的條件還不錯，那裏備有特別的房屋，生活方便，甚至允許朋友親人隨時看望，允許章太炎在那裏接待客人。
盡管如此，章太炎剛進來時非常失望，因為他發現除了自己外，不論是張園演講會，還是《蘇報》案，都沒有什麽重要人物，吳稚暉、蔡元培、章士釗、陳範等都跑了，隻有他一個人被抓捕。恐懼、失落、不平衡或許一度占了上風，於是他莫名其妙地寫信給鄒容和龍澤厚，訴說自己的寂寞與恐懼，希望這兩位兄弟能夠男子漢敢作敢當，前來自首。
老大的勸說真的起了作用，鄒容和龍澤厚接到章太炎的信後，競欣然於7月1日跑到巡捕房投案自首。
鄒容、龍澤厚的做法使巡捕房大吃一驚，因為他們很少遇到這樣的事，以為真假難辨，未敢遽收。鄒容見狀反而急了，強調我不是鄒容，豈肯自投羅網？巡捕房隻好暫時收押。
7月15日，會審公廨將章太炎、鄒容、龍澤厚及《蘇報》館賬房程吉甫、假孫中山錢寶仁、陳範的兒子陳仲彝等六人提往審訊。
此次審訊比較搞笑的是原告方為中國政府，而被告則是這幾個中國人。會審公廨讞員孫建臣高聲宣布傳“中國政府到案”，宜布“中國政府控告《蘇報》館大逆不道，煽惑亂黨，謀為不軌”；宣布“中國政府控告章炳麟大逆不道，煽惑亂黨，謀為不軌”等，讓人聽著總覺得刺耳和不舒服，堂堂一個政府竟然與幾個人成了對手，成了控辯雙方。這自然使章太炎等人更加自信，當他聽到這些話語時，不禁覺得以中國政府控告他，這也算是他的光榮，而且這個控告不在他國法院，而在中國自己所管轄的最小的新衙門，真是千古笑柄。
原告指控章太炎的，除了革命排滿外，還牽涉章太炎引玄燁、弘曆、載湉小醜等語，認為幹犯廟諱，指斥乘輿，悍然攻擊皇太後和當今聖上。