許多患者在谘詢手術治療相關信息的時候，往往會表現出對手術副作用的擔憂。副作用，即手術後可能存在的並發症。手術治療後可能存在哪些並發症呢？這與選取的手術術式及術後時間有密切關係。
術後近期並發症
術後4周內發生的並發症為術後近期並發症，常見出血、吻合口瘺、吻合口狹窄、內疝與腸梗阻及靜脈血栓栓塞症等。
出血：出血是外科手術常見的術後並發症，對於手術治療來說，行胃旁路術患者術後出血的發生率（1.9%～4.4%），較行SG（0.7%～1.4%）患者高。術後出血可來自吻合口、胃切緣、腸係膜邊緣以及腹壁切口等部位。出血的原因包括圍手術期使用了抗凝藥和非甾體類藥物、術中操作不當和術後嚴重嘔吐等。但隨著微創外科技術的發展和醫生技術的不斷提高，這一並發症的發生率在臨床中較低。預防術後出血的關鍵在於術中精準操作和圍手術期多學科協作，術中仔細檢查各吻合口和切緣等。
吻合口瘺：胃旁路術後吻合口瘺的發生率為1.1%～1.4%，多發生在胃空腸吻合口；SG術後殘胃漏發生率為0.7%～7.0%。吻合口瘺與殘胃瘺的高危因素主要包括血供不足、縫合不嚴密、局部感染、合並糖尿病等。臨床表現為全腹彌漫性的疼痛、壓痛、反跳痛、肌緊張等腹膜炎表現、心動過速、發熱等。這一並發症的發生率也主要與醫生的手術技術密切相關。一旦發生吻合口瘺，首先會給予內科保守治療；如治療無效，可考慮內鏡下放置鈦夾或生物膠，甚至再進行手術放置引流管或重新縫合關閉瘺口。
吻合口狹窄：胃旁路術後吻合口狹窄的發生率為3%～6%，術後早期的狹窄可能與吻合口過小、水腫和組織內翻有關。吻合口狹窄的主要表現為嚴重的惡心嘔吐。早期狹窄的病可先予禁食水或全流質飲食，觀察期是否恢複，效果不佳者考慮內鏡下球囊擴張，必要時應再次進行手術。