萬曆五年七月，兵備道拿住帥嘉謨，把他關在監牢裏待審。同時被捕的，還有包括程任卿在內的一夥五縣鬧事分子。
兩個月後，徽州府終於拿出了初審判決：帥嘉謨、程任卿以及其他幾個人，被判充軍。其中帥嘉謨的罪名是“將不幹己事情，捏造寫詞，聲言奏告，恐嚇得財，計贓滿貫”“以陳奏而斂取”。
在狀詞裏，徽州府描述了這樣一個“事實”：帥嘉謨自誇有手段，向歙縣老百姓收取銀錢，說你們補貼我上京告狀，我自有辦法幫你們免征賦稅。他利用歙縣民眾的恐慌心理，收斂了大量錢財，假公濟私——比如私自弄了套冠帶，用的就是公款。
這是一個欲加之罪的政治性判決，翻譯過來就五個字：“誰讓你多事？”從官府視角來看，這起紛爭根本是無中生有，完全是帥嘉謨一個人挑起來的，當初你如果乖乖閉嘴做你的數學作業，哪兒還會有後麵這麽多事？
所以官府毫不猶豫地犧牲掉帥嘉謨，來換取五縣的穩定。至於這個罪名是否合理，並不在考慮之列。法律問題，咱們政治解決。
初審意見提交給兵備道。可是馮叔吉很不滿意，覺得徽州府怕得罪人，給判輕了，不足以警誡別人。於是馮叔吉把這些人提到太平府，讓安慶、池州、太平三府會審，再議一次罪名。
這次商議，最終給帥嘉謨定的處罰是“杖一百流三千裏，遣邊戍軍”。這個判罰，從他本人角度來說實在是冤枉，但從官府角度，沒弄死你，算是很講良心了。
萬曆六年七月十九日，這份判決意見得到刑部尚書嚴清的支持，具題上奏，並於二十日拿到聖旨批準。一切都塵埃落定。
然後，帥嘉謨在官差的押解下離開徽州，踏上了漫漫的戍邊之路。他當時是何心情，後來又發生了什麽，我們不得而知。但值得欣慰的是，歙縣民眾並沒忘記這位幫他們減賦的英雄。在《歙縣誌》裏的義士一項，專門記載了帥嘉謨的事跡，以及一段評語：“以匹夫而塵萬乘之覽，以一朝而翻百年之案。雖遭謫戍，而歙人視若壯夫俠士。”