企業在自主創新過程中，首先要明確自身發展的方向，需要結合自身的技術優勢，選擇一條符合企業特點的創新之路。企業不能為了得到國家的一些政策優惠，而不顧自身創新能力的大小，盲目上項目，這樣不但不能帶來有效的技術創新，反而會引起巨大成本，甚至引起企業的倒閉。其實，企業自主創新所涉及的範圍非常寬泛，隻要能給企業帶來新價值的技術變革，都應是自主創新。企業需要做的是選擇一個適合自身優勢的創新方向。具體來講，企業需要從技術的產業布局，技術用途和技術含量三個方麵認真考慮後做出創新方向的選擇。
從技術的產業布局考慮，企業的自主創新有三個方向。第一，傳統技術方向。企業的產品為傳統產品，主要生產技術已基本定型，很難有突破性提高。企業的技術目標主要是降低單位成本、提高產品質量、形成生產和技術標準、完善售後服務等。選擇傳統技術方向，並不等於摒棄技術進步，而是基於傳統技術的不斷發展。這種發展和創新可能是緩慢和不顯著的，但長期的積累會產生驚人的效應。如鋼鐵冶金行業，雖然幾十年來主要的產品和生產技術並無根本改變，但操作的自動化、精密化程度已不可同日而語，產品質量有了飛躍性的提高。第二，高新技術方向。高新技術是一係列新技術、新領域的總稱，包括信息技術、現代生物技術等。一般來說，高新技術在其發展過程中有兩個方向，一個是用高新技術改造傳統產業，另一個是高新技術本身的產業化。第三，混合型技術方向。創新的方向也會以混合形態出現，高新技術與傳統技術有機結合在一起，產生一個同時涵蓋高新技術和傳統產業的新產業。
從技術用途考慮，企業的自主創新有兩大方向。第一，克服負效應的技術開發。主要是從一種新技術產生的社會不良後果出發，力爭將負效應轉變為積極效應。在技術開發中，技術上獲得成功但總體上遭受失敗的教訓不勝枚舉。比如20世紀40年代，米勒發明了高效殺蟲農藥DDT，獲得了1948年諾貝爾生理學和醫學獎，但到了70年代，DDT引起了嚴重汙染，人們不得不停止生產這種農藥。這些問題不是來自技術本身，而是受到自然規律的作用，帶來環境、社會、經濟等方麵的壓力。克服負效應的技術開發，主要是提高產品的技術含量，減少產品的有害性，增加產品的適應性從而開拓市場。第二，需求滿足型技術開發。主要是致力於加速產品的更新換代，擴大產品的花色品種，提高產品的使用性能，將各種領域的新技術向日用消費領域轉移，從而換取巨大的經濟效益。除了關注科學技術的重大突破外，還應關注技術對需求的推動作用。我國目前有效需求不足的一個重要原因，就是缺乏刺激需求的技術創新，導致一些有錢人在現有的技術水平下沒有消費。