一般來說，進行個案研究分為五個步驟：確定主題和研究對象、收集資料、案例分析、指導與追蹤、撰寫個案研究報告和論文。
1.確定個案研究的主題和研究對象
有效地選擇研究對象十分重要，這關係到所得出的結論是否有價值。從事教育工作的教師，為了探索提高教育教學質量的方法，完全可以把研究對象確定在與此相關的人與事例上，例如關於學習困難學生的研究，對學習困難學生個性發展的研究，對學習困難學生不良行為形成的原因與對策的研究等。個案研究對象的確定，一般可以選擇有一係列不同於他人的行為表現，而且對這些行為形成的原因、特點、發展趨勢的重要性認識不甚清楚，而又有搞清楚它的必要和興趣。研究對象確定後，隨之而來的工作就是要對個案現狀進行了解與評定。一般個案現狀評定的基本內容除包括個案表麵現狀突出的方麵，有專門的測量與評定之外，還應對個案的現狀有一個全麵的了解與評定。總之，了解、評定那些有助於研究者認識個案各方麵發展的平行、協同的關係，有助於發現個案潛在發展趨勢的現狀。僅以研究學生學習障礙為例，可以考慮個案的各科學業成績，智力測驗成績，個性測驗情況，個人的興趣愛好，父母的文化水平、職業及興趣愛好，家庭教養、經濟、成員間的關係，社會交際能力及教師教學情況等。確定個案是指確定研究及輔導對象。首先，教師必須明確自己要研究的問題究竟是什麽，這樣才能有目的、有意識地去尋找符合條件的個案。其次，要對所研究問題涉及的主要概念形成明確的定義。比如，教師打算研究“學習困難”這個問題，就一定要對學習困難有明確的定義，清楚學習困難的操作性定義以及學習困難的特征和表現。最後，在初步選定了符合條件的個案後，通過實地查看、調查詢問、查閱資料等形式，了解被研究者的情況，綜合考慮時間、路程、經費等問題，從中挑選有研究價值、有代表性和典型性並且切實可行的個案來進行深入研究。