李秀成大軍攻進杭州，占領的是漢人聚居的舊城。杭州將軍瑞昌堅守滿城（旗下營），李秀成就地踏步，再也不發動進攻。
他出乎尋常，在徘徊，在等待，按兵不動。
杭州的失陷，引起附近各處清軍的重視，先後趕來的有五支人馬：
一、督辦安徽軍務張芾部總兵米興朝部駐紮杭州城外流芳鎮；
二、副將王夢麟部二千人駐紮餘杭；
三、浙江按察使段光清等殘部駐紮海寧；
四、海盜、守備布興有水師駐紮錢塘江；
五、衢州鎮總兵李定太駐紮海寧長安鎮。
杭州危急時，鹹豐帝調動江南大營，還聽從何桂清建議，命和春兼辦浙江軍務，江南大營提督張玉良總統援杭各路人馬。
3月10日，張玉良從天京外圍率領大營五分之二軍力赴援杭州。21日，張玉良到杭州時，杭州已失守。23日晨，張玉良在城外大關巡視前沿部隊，李秀成在城頭發現張玉良旗號，知道江南大營援軍已經趕到，表明此次突擊杭州城，已經達到了預期功效，便於當天深夜，全軍悄悄地撤出杭州城。臨撤之前，李秀成在城頭遍插旗幟，以為疑兵之計。24日，張玉良仍在城外列陣，見城頭旗幟飄揚，不敢臨城。杭州將軍瑞昌派間諜溜進城門，發現杭州已是空城，無一人一騎，隨即通知了張玉良。
張玉良為邀功計，故意在錢塘門、昭慶寺、吳山和校場等處太平軍遺留軍營處呼嘯而入，還放了幾把火，然後擁進城去，算是收複了杭州城。
張玉良軍進城後忙於搶掠，聽憑李秀成軍遠去。
李秀成計誘江南大營分兵的目的達到，大為高興。他說：
我非一心去打杭郡，見和、張兩帥困我主及我母親在京，知和、張兩帥軍餉俱出在蘇、杭、江西、福建、廣東，此是出奇兵而製勝，扯動和、張兩帥江南之兵，我好複兵而回，救解天京之謀，非有立心去打杭郡。打入城內，連戰數日，滿營未破，然後和、張兩帥果派江南救兵來救杭郡，令張玉良統帶到杭郡武林門，兩家會話，知是江南和、張之兵分勢，中我之計。次日午時，將杭郡新製造旗幟以作疑兵，此是兵少退兵之計。不意張玉良果中我謀，退出一日一夜，未敢入城，我故而得退不礙。