康熙帝決定撤藩。三藩勢成割據，嚴重威脅著清朝的統治和國家的統一。早在清世祖死時，吳三桂擁兵北上入祭，兵馬塞途，居民走避，清廷恐吳三桂生變，命其在城外張棚設奠，禮成即去。後來，朝中也有一些官員提出要限製三藩的實力，其中就有一個叫王熙的官員上疏指出：“宇內甫平定，而三藩各擁重兵，吳三桂尤強，擅署置官吏，寢驕蹇，萌異誌，子應熊以尚朱，居京師，多聚奸人，散多錢交通四方。”他向朝廷提出建議，裁剪三藩的軍隊數量以及他們的軍餉，這樣不但能削弱三藩的實力，也能充實國庫。
其實，在康熙登基、四大臣輔政時，朝廷就開始準備一步步收回和削弱三藩的勢力和權力了。比如，吳三桂手上有一枚“大將軍印”，這是順治帝授予給他遠征雲貴的，以此掌握征伐大權，但是吳三桂在平定了雲貴後，這枚“大將軍印”他卻遲遲不肯上交，在四輔臣的反複促使下，吳三桂被迫將“大將軍印”上交。
康熙五年，玄燁還未親政，朝廷又將三藩的用人題補之權裁除去，而過去吳三桂對雲貴、廣東、福建的官吏任免權也收獲。
康熙親政後，一開始並沒有命令宣布撤三藩，他采取軟硬兼施、循序漸進的方法，一方麵安撫三藩，另一方麵派朝廷官員到雲貴、廣東、福建擔任總督、巡撫等要職，對三藩的勢力進行約束。而吳三桂等人則嗅到了清廷對自己的政策變動的氣息，他最害怕的是朝廷“過河拆橋”“卸磨殺驢”，所以不斷試探朝廷，不過他在自己的利益沒有受到損害的情況下，他也適度妥協了一些，不過三藩和朝廷之間的矛盾早已不可調和，尤其是軍權上，三藩始終不肯交出，這成了後來康熙撤三藩的最大原因。
怪在這緊要關頭，一個突然的事件引發了朝廷一場撤藩還是不撤藩的大討論。