在台灣問題上，康熙一直堅持：“主權領土是涉及國家大利害的問題，在這個問題上，必須寸土必爭，不容有絲毫讓步。”因此，在是否留守台灣這個問題上，康熙目光長遠，堅持抵製放棄台灣的聲音，在台灣設立府縣，建立長期駐軍的製度，這對於祖國統一和台灣的發展有著深遠的影響。
康熙十九年（1680年）鄭經返台後，縱情酒色，怠聞軍政，將台灣事務均委與長子鄭克臧與大臣陳永華。康熙二十年（1681年）三月十七日，鄭經於台灣承天府去世，終年40歲。
鄭經死後，由長子鄭克臧繼位，鄭克臧知書達禮，是一個合格的接班人，而且早在康熙十八年（1679年），鄭經率師西征時，就留他奉命監國，由其嶽父陳永華輔政。
但隨後，鄭氏集團內部再次發生內亂，馮錫範、劉國軒發動政變，鄭克臧被殺，年僅十二歲的鄭克塽被擁立繼位，政權內部人心不穩，馮錫範為了立威，準備殺人，軍中上下都打算向大清投誠，這樣一來，整個鄭氏集團已經是搖搖欲墜了。
此時，姚啟聖立即上疏朝廷，建議趁機攻取台灣，康熙立即召開朝廷內部會議，商議具體策略，李光地舉薦施琅重新擔任福建水師提督，因為施琅精通水上情形，且富有戰略思想，整個鄭氏集團聽到其名都聞風喪膽，姚啟聖更是一再舉薦，而施琅曾經在四大臣輔政時期所上的《盡陳所見疏》此時也被重新提上日程。
從施琅的自身條件來看，他的確是攻台清軍主將的合適人選。首先，施琅生長在海邊，自幼隨父從事海上貿易活動，精通航海，對海疆的氣候、地理等方麵的情況了如指掌，施琅從軍後，轉戰東南沿海，有豐富的海戰經驗。其次，施琅通曉兵法、戰陣，並一貫主張以武力統一台灣，所以多年來精心謀劃對台用兵方略，提出“因剿寓撫”的戰略方針及一整套實施方案，不但周密完備，而且是切實可行的。再次，施琅是從鄭氏陣營中反叛出來的，他熟悉台灣鄭氏集團內情，他的智勇韜略也一向為鄭軍官兵所畏懼，他在鄭氏集團中的故舊很多，為他爭取內應和進行情報工作提供了便利條件。最後，施琅不但是武力統一的堅決擁護者，而且對統一充滿信心。