分化瓦解鄭氏力量
康熙親政以來，有三件大事在他的腦海內是必須要完成的——除鼇拜、撤三藩、收複台灣。和前麵兩件事相比，很明顯，收複台灣更有挑戰性，因為清軍主要是八旗子弟、不善水性，對於他們來說，要越過幾百裏的海峽攻打下鄭氏長期據守的台灣是有很大難度的。
台灣島是中國的第一大島，位於中國大陸東南海域，東臨太平洋，西隔台灣海峽與福建省相望，南界巴士海峽與菲律賓群島相對。台灣包含中國第一大島台灣島和周圍屬島以及澎湖列島兩大島群，共80餘個島嶼所組成，總麵積3.6萬平方公裏。
台灣自古以來與內地有著密切的聯係。遠古時代台灣與大陸相連，約幾百萬年前由於地殼運動，部分陸地下沉，海水進入，形成台灣海峽，台灣島才與大陸分離。三國時期，吳王孫權派將軍衛溫、諸葛直率一支由一萬餘名軍士、三十多艘船組成的船隊到達夷洲（今台灣），是中國大陸居民利用先進的文化知識開發台灣的開始。
宋元時期，漢族人民在澎湖已有相當數量。漢人開拓澎湖後開始向台灣發展，帶去先進的生產技術。12世紀中葉南宋將澎湖劃歸福建路晉江縣（今福建晉江）管轄，並派兵戍守。大陸和台灣的聯係日漸頻繁。
元朝進一步加強對台灣的管理。元世祖曾派員到台灣宣撫，並在澎湖設澎湖巡檢司，隸屬福建泉州路同安縣（今福建廈門），雖然沒有直接將台灣島並入其內，卻是中國中央政府對台灣地區的首次官署設置。
明朝初期仍設澎湖巡檢司，直至1387年因實施海禁而廢除，並把居民遷到漳州、泉州一帶。1563年考量沿海治安等因素，複設澎湖巡檢司。
明朝以後大陸與台灣的人民往來不絕。永樂年間鄭和率船隊曾在台灣停留。17世紀20年代的明朝末葉大陸居民開始大規模移居台灣，給台灣社會經濟和文化的發展以極大推動。其時福建人顏思齊、鄭芝龍為抗拒官府欺壓率閩粵居民遷居台灣，一麵從事農耕、貿易，另一麵組織武裝力量抗禦倭寇和荷蘭人。1628年閩南大旱，百姓無以為生，鄭芝龍組織災民數萬到台灣墾荒定居，各地逐漸形成許多村落。台灣自此進入大規模開發時期。