於謙回到家中，苦思冥想，對當前京城的情況做了一番調查，又擬定了詳細計劃，四天後的早朝，於謙進諫：“太後，微臣認為，皇上親征，完全是宦官王振慫恿，所以，臣請求將王振誅九族，以平息民憤。”
此言一出，眾大臣無不隨聲附和，拍手叫好，這王振才是導致皇上被俘的罪魁禍首，多年把持朝政，搞得人心惶惶，現在於謙提出滅門，正是大快人心。
太後道：“準奏！”
於謙又提出幾項穩定軍心的措施，太後皆準。
接下來的五天裏，於謙與百官商議，決定聯名上書，請求太後改立郕王朱祁鈺為帝，遙尊被俘的英宗朱祁鎮為太上皇帝。
五天後的早朝，文武百官聯名上書，於謙進諫道：“臣以為瓦剌軍隊之所以勢如破竹，其中的一個原因是因為他們以皇上做要挾，社稷為重，君為輕，所以臣與百官請求立監國郕王為帝，遙尊皇上為太上皇。這樣瓦剌軍首領也先的陰謀就不能得逞。”
太後道：“所言甚是，準奏。”
於謙又道：“臣認為曆史上沒有常勝將軍，請求釋放逃回的原大同副將石亨，並加升官職。另外再三答應中挑選十萬精銳，分十營團練，以備緊急調用。以京城的火器部隊、騎兵部隊來鎮守大同、宣府、居庸關、紫荊關等重要關口。”
太後聽後點頭道：“準奏，另外封石亨為京師總兵官，統一指揮京師步兵部隊。”
眾官跪下齊道：“太後聖明。”
朱祁鈺登基後改年號為景泰，是為明代宗，他封於謙為兵部尚書，授予於謙提督各營兵馬重任，命在京的各營將領皆接受其節製，將士凡有違抗軍令者，於謙有先斬後奏之權。
瓦剌軍即將打來，於謙注意提拔一批有才能的將領，將蕭覬飛他們也編入隊伍。同時，從各地調來兵力，日夜趕造武器，裝備軍隊。在北京周圍。布置兵力，嚴把九門，注意日夜操練軍隊，迅速地提高戰鬥力。隨後兩京、河南、山東等地的勤王部隊也陸續趕到，於謙嚴整軍紀，並選撥新進將領操練軍兵，分守九城，並命令邊防部隊加緊修固沿邊大小關隘。